MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI5S5 complete sequence

Total Repeats: 799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020535	T	6	6	113	118	0 %	100 %	0 %	0 %	469816295
2	NC_020535	AGA	2	6	124	129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816295
3	NC_020535	T	6	6	167	172	0 %	100 %	0 %	0 %	469816295
4	NC_020535	GA	3	6	229	234	50 %	0 %	50 %	0 %	469816295
5	NC_020535	GATA	2	8	265	272	50 %	25 %	25 %	0 %	469816295
6	NC_020535	AT	3	6	284	289	50 %	50 %	0 %	0 %	469816295
7	NC_020535	A	7	7	338	344	100 %	0 %	0 %	0 %	469816295
8	NC_020535	A	6	6	356	361	100 %	0 %	0 %	0 %	469816295
9	NC_020535	A	6	6	390	395	100 %	0 %	0 %	0 %	469816295
10	NC_020535	AAAC	2	8	406	413	75 %	0 %	0 %	25 %	469816295
11	NC_020535	TTTA	2	8	423	430	25 %	75 %	0 %	0 %	469816295
12	NC_020535	ACAAG	2	10	499	508	60 %	0 %	20 %	20 %	469816295
13	NC_020535	AC	3	6	592	597	50 %	0 %	0 %	50 %	469816295
14	NC_020535	AAT	2	6	653	658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816295
15	NC_020535	ATGA	2	8	659	666	50 %	25 %	25 %	0 %	469816295
16	NC_020535	AT	3	6	730	735	50 %	50 %	0 %	0 %	469816295
17	NC_020535	AATT	2	8	756	763	50 %	50 %	0 %	0 %	469816295
18	NC_020535	TAA	2	6	775	780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816295
19	NC_020535	GAA	2	6	791	796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816295
20	NC_020535	A	6	6	830	835	100 %	0 %	0 %	0 %	469816295
21	NC_020535	TAA	2	6	841	846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816295
22	NC_020535	AGA	2	6	871	876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816295
23	NC_020535	GAA	2	6	884	889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816295
24	NC_020535	A	6	6	929	934	100 %	0 %	0 %	0 %	469816295
25	NC_020535	GAA	2	6	992	997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816295
26	NC_020535	TAT	2	6	1009	1014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816295
27	NC_020535	GAA	2	6	1017	1022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816295
28	NC_020535	A	6	6	1021	1026	100 %	0 %	0 %	0 %	469816295
29	NC_020535	A	6	6	2223	2228	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
30	NC_020535	GTTTT	2	10	2257	2266	0 %	80 %	20 %	0 %	469816296
31	NC_020535	T	6	6	2263	2268	0 %	100 %	0 %	0 %	469816296
32	NC_020535	C	6	6	2276	2281	0 %	0 %	0 %	100 %	469816296
33	NC_020535	AGAA	2	8	2375	2382	75 %	0 %	25 %	0 %	469816296
34	NC_020535	A	9	9	2428	2436	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
35	NC_020535	A	7	7	2499	2505	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
36	NC_020535	TA	3	6	2580	2585	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
37	NC_020535	AAT	2	6	2595	2600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
38	NC_020535	AT	3	6	2620	2625	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
39	NC_020535	A	6	6	2640	2645	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
40	NC_020535	TAT	2	6	2650	2655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
41	NC_020535	TGT	2	6	2756	2761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816296
42	NC_020535	TAAA	2	8	2851	2858	75 %	25 %	0 %	0 %	469816296
43	NC_020535	ATT	2	6	2866	2871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
44	NC_020535	TAT	2	6	2895	2900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
45	NC_020535	TAAT	2	8	2917	2924	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
46	NC_020535	TAA	2	6	2929	2934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
47	NC_020535	ATT	2	6	2949	2954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
48	NC_020535	TAATT	2	10	2972	2981	40 %	60 %	0 %	0 %	469816296
49	NC_020535	TCC	2	6	2996	3001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	469816296
50	NC_020535	GTT	2	6	3036	3041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816296
51	NC_020535	TA	3	6	3172	3177	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
52	NC_020535	TAA	2	6	3203	3208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
53	NC_020535	ATT	2	6	3239	3244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
54	NC_020535	A	6	6	3249	3254	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
55	NC_020535	TA	3	6	3262	3267	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
56	NC_020535	A	6	6	3267	3272	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
57	NC_020535	TTG	2	6	3299	3304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816296
58	NC_020535	AT	3	6	3324	3329	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
59	NC_020535	GGTT	2	8	3342	3349	0 %	50 %	50 %	0 %	469816296
60	NC_020535	AAC	2	6	3356	3361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816296
61	NC_020535	ATT	2	6	3378	3383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
62	NC_020535	AAT	4	12	3387	3398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
63	NC_020535	AAGG	2	8	3423	3430	50 %	0 %	50 %	0 %	469816296
64	NC_020535	AGT	2	6	3546	3551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816296
65	NC_020535	AAT	2	6	3567	3572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
66	NC_020535	TGA	2	6	3587	3592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816296
67	NC_020535	ATA	2	6	3622	3627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
68	NC_020535	AGA	2	6	3671	3676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816296
69	NC_020535	GTTTG	2	10	3687	3696	0 %	60 %	40 %	0 %	469816296
70	NC_020535	CAT	2	6	3723	3728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816296
71	NC_020535	CTA	2	6	3835	3840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816296
72	NC_020535	TCT	2	6	3855	3860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816296
73	NC_020535	A	7	7	3906	3912	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
74	NC_020535	TTA	2	6	3934	3939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
75	NC_020535	AATT	2	8	3949	3956	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
76	NC_020535	TAG	2	6	4039	4044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816296
77	NC_020535	ATA	2	6	4078	4083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
78	NC_020535	TAA	2	6	4106	4111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
79	NC_020535	TAA	2	6	4130	4135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
80	NC_020535	TAA	2	6	4195	4200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
81	NC_020535	AAT	2	6	4221	4226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
82	NC_020535	ATTA	2	8	4250	4257	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
83	NC_020535	CAATA	2	10	4268	4277	60 %	20 %	0 %	20 %	469816296
84	NC_020535	A	6	6	4338	4343	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
85	NC_020535	AAC	2	6	4373	4378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816296
86	NC_020535	A	6	6	4420	4425	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
87	NC_020535	AAAG	2	8	4479	4486	75 %	0 %	25 %	0 %	469816296
88	NC_020535	TTA	2	6	4489	4494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
89	NC_020535	T	6	6	4634	4639	0 %	100 %	0 %	0 %	469816296
90	NC_020535	AAT	2	6	4655	4660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
91	NC_020535	A	6	6	4679	4684	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
92	NC_020535	ATA	2	6	4699	4704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
93	NC_020535	TCT	2	6	4743	4748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816296
94	NC_020535	A	7	7	4818	4824	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
95	NC_020535	TAA	2	6	4838	4843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
96	NC_020535	TCT	2	6	4857	4862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816296
97	NC_020535	GAT	2	6	4881	4886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816296
98	NC_020535	TAT	2	6	4948	4953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
99	NC_020535	AATT	2	8	4975	4982	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
100	NC_020535	AG	3	6	4998	5003	50 %	0 %	50 %	0 %	469816296
101	NC_020535	CAA	2	6	5019	5024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816296
102	NC_020535	A	6	6	5030	5035	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
103	NC_020535	ATT	2	6	5090	5095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
104	NC_020535	TAA	3	9	5195	5203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
105	NC_020535	TTA	2	6	5220	5225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
106	NC_020535	AAAC	2	8	5230	5237	75 %	0 %	0 %	25 %	469816296
107	NC_020535	CTA	2	6	5785	5790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816297
108	NC_020535	AT	3	6	5817	5822	50 %	50 %	0 %	0 %	469816297
109	NC_020535	GTG	2	6	5841	5846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	469816297
110	NC_020535	TCA	2	6	5854	5859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816297
111	NC_020535	GAA	2	6	5914	5919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816297
112	NC_020535	A	6	6	5927	5932	100 %	0 %	0 %	0 %	469816297
113	NC_020535	TTA	2	6	5935	5940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816297
114	NC_020535	TGA	2	6	5953	5958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816297
115	NC_020535	ACAT	2	8	6019	6026	50 %	25 %	0 %	25 %	469816297
116	NC_020535	TTA	2	6	6075	6080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816297
117	NC_020535	TTAAAC	2	12	6174	6185	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	469816297
118	NC_020535	GAAA	2	8	6676	6683	75 %	0 %	25 %	0 %	469816298
119	NC_020535	GAA	2	6	6725	6730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816298
120	NC_020535	AAAC	2	8	6767	6774	75 %	0 %	0 %	25 %	469816298
121	NC_020535	AT	3	6	6796	6801	50 %	50 %	0 %	0 %	469816298
122	NC_020535	TAA	2	6	6810	6815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816298
123	NC_020535	A	7	7	6838	6844	100 %	0 %	0 %	0 %	469816298
124	NC_020535	ACAAT	2	10	6888	6897	60 %	20 %	0 %	20 %	469816298
125	NC_020535	ACA	2	6	6905	6910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816298
126	NC_020535	TAA	2	6	6951	6956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816298
127	NC_020535	AGA	2	6	6973	6978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816298
128	NC_020535	ACT	2	6	7027	7032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816298
129	NC_020535	CGA	2	6	7042	7047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469816298
130	NC_020535	CAAAAA	2	12	7049	7060	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	469816298
131	NC_020535	ATT	3	9	7128	7136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816298
132	NC_020535	TTA	2	6	7892	7897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816299
133	NC_020535	ATA	2	6	7907	7912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816299
134	NC_020535	AAT	2	6	7920	7925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816299
135	NC_020535	ATA	2	6	7952	7957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816299
136	NC_020535	TTG	2	6	8072	8077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816299
137	NC_020535	AT	3	6	8108	8113	50 %	50 %	0 %	0 %	469816299
138	NC_020535	ATA	2	6	8185	8190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816299
139	NC_020535	TGA	2	6	8217	8222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816299
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141	NC_020535	ATT	2	6	8259	8264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816299
142	NC_020535	ATT	2	6	8286	8291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816299
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